WordPressマルチサイトでサイト作成時の初期テーマを変更する

wp-includes/default-constants.php
の315行目（WordPressのバージョンによって違うかも）

define( 'WP_DEFAULT_THEME', 'twentyfourteen' );

上のtwentyfourteenの部分をサイト作成時に設定したいテーマの名前にすることで、WP_DEFAULT_THEMEというデフォルトテーマの設定に使われる定数が書き換わるので、デフォルトテーマがそのテーマになります。